Il Direttore Vance ritorna agente sul campo poiché la morte di un marine sembra essere legata al suo ultimo caso da agente speciale. Inoltre, il direttore sembra coinvolto in un secondo omicidio e il segretario della Marina comincia a pensare di porre fine all'incarico di Leon. Nel finale, il direttore Vance viene ferito e il segretario organizza una conferenza stampa (per comunicare il termine dell'incarico di Vance?). Quando Vance e Gibbs tornano dalla conferenza, DiNozzo e gli altri sono ansiosi di sapere cosa ha deciso il segretario. Vance comunica di essere ancora al comando dell'N.C.I.S.
