Michael mette in dubbio le certezze di Nikita sul loro futuro insieme, lontano dalla Divisione e non è l'unico ad avere dubbi. Purtroppo Amanda è ancora una minaccia persistente, specie adesso che si è alleata con dei nuovi partner che le hanno fornito un'arma terrificante. Alex prende in considerazione un'allettante offerta dal Premio Nobel che sta proteggendo.