Ryan si fa carico della Divisione con Nikita al suo fianco. La loro prima missione è occuparsi degli agenti che non hanno risposto all'ordine di rientro dopo la morte di Percy. Purtroppo la missione è un fallimento, Michael viene arrestato forzando Nikita a organizzare un piano di fuga. Alex riprende la sua falsa identità, quella della principessa Alexandra Udinov, per liberare Michael. Intanto Birkhoff cerca di rimanere in relazioni professionali con Sonya, nonostante i sentimenti che prova per lei.