由于服部赢得了推理比赛，所以和叶不得不妥协去和柯南、小兰等人一起去甲子园球场观看全日本高中棒球赛，这里不仅因聚集了来自全国的各地的棒球精英而名声大噪，还有四百三十颗翠绿的常春藤也让人赏心悦目。比赛刚开始就让全场的观众热血沸腾，然而就在这样热情的氛围之下，似乎有着什么不可知的危机正慢慢靠近…… 大金和港南高中的比赛如火如荼的进行着，坐在一旁的大龙警官看着这些在赛场上挥洒汗水的年轻人不禁怀念起了曾经为棒球而努力的自己，然而这个地方有人爱自然也有人恨，这时，被人遗落在服部脚边的手机响起，没想到这竟然是一通恐吓电话，这个自称甲子园恶魔的人让服部在比赛结束前，找到他在观众席留下的三支写有线索的手机以及他自己的的位置，否则后果不堪设想，情况危急，服部，柯南和大龙警官便在这茫茫几万人的球场中展开了搜查。 紧张的气氛不仅围绕在赛场上，在场下寻找另一支写有其他线索手机的柯南、服部和大龙警官也正在绞尽脑汁的破解暗号，柯南还特意借来小五郎的收音机以方便了解赛场上的情况，所幸在第二支手机响起之时被服部顺利找到，可接下来等待他们的却是另外一组费解的数字，经过商量，三人决定分头行动，虽然最终还是找到了第三只手机，但里面的所留下的线索只有一个括号和数字13，柯南和服部能否解开这个不同于前两次的数字暗号？ 柯南和服部必须在第九局下半场前解开暗号，可是时间已经不多，这个空白暗号到底代表着什么，这时，柯南灵光一现想起了看台上所缺少的17和22号门，但情况危急，必须争分夺秒，之后服部和柯南推断出了暗号所指的位子，没到竟然就在小兰她们附近，三人紧忙跑去，果然找到了第三支手机，根据手机上的数字，柯南很容易就找到了这个甲子园恶魔的位置，而他又有什么样的苦衷？
