【主线剧情】打算盗取铃木财阀家的黑珍珠BLACK STAR的怪盗基德，想起了以前关于钟台的一个事件，那是工藤新一和怪盗基德的第一次交手。另一方面，小五郎的事务所里收到一封附有支票的不明发信人的信函，并且在其上方还有一行奇怪的话语。 小五郎带着小兰和柯南来到“黄昏别馆”，途中还偶遇了同是侦探的千间降代，当他们到达之后才发现，此次受邀前来的茂木遥史、大上祝善、枪田郁美和白马探都是名侦探，而在这栋别墅内随处可见陈年的血迹。在晚宴上，本以为能一睹这位别墅主人尊容的各位侦探却扫兴的发现，他居然头戴面罩，并且还阻断了所有道路，要求侦探们在这栋孤立无援的别墅内帮他寻找宝藏。 大家小心翼翼的吃完晚餐后，这具代替主人的假人偶再次开口并讲述了四十年前在这栋别墅中所发生的惨案，而他的目的则是让悲剧重演，这时，大上祝善当着大家的面中毒死亡，而和小五郎、茂木一起开车去察看吊桥状况的千间也因车子爆炸而生死未卜，返回别墅之后，柯南、小五郎和茂木在钢琴房中发现了很多线索，然而却突然响起了枪声，三人赶到时，白马探已经死亡，随后，枪田郁美的尸体也在电脑房被发现。 茂木认为小五郎是凶手而开枪将他射伤，当前来“黄昏别馆”的所有名侦探都命丧黄泉时，电脑上居然出现了一行关于宝藏的信息，一直躲在监视器操控室的神秘幕后黑手终于按捺不住露出了真面目，没想到这个人居然是……柯南引导她说出了整件事的真相，而这时，本应死去的侦探们居然都出现在门口，可到底是怎么回事？这栋别墅的宝藏又是什么？
