机器人统治者正面临着前所未有的威胁。佐尔的变节，克隆人的造反，缪西卡的叛逃，是泰洛人整个社会瓦解的一种先兆，而最关键的是他们的史前能量已有70％被生命之花所吮吸污染，因此整个泰洛文明也渐趋衰退。为了弥补这种损失，他们决定改变战略，赶在因维人到来之前夺取地球上所有未受污染的史前能量，即使那样会毁了地球也在所不惜。 驻留在阿路司基地的爱默森将军发现泰洛军队已经发动了总攻，并接到了伦纳德司令关于和敌人决一死战的命令。他心情沉重的通知刚结束战斗的玛丽和布朗再次出击。 鲍威尔和缪西卡连夜出逃。因为告密的事佐尔受到戴纳的指责，但他表现出来的消极态度让戴纳震惊不已。经过一夜的奔走，第二天清晨鲍威尔和缪西卡来到SDF-1的废墟。这里的花和上次鲍威尔看见的已经大相径庭，所有的花都正陆续开放，散播出无数金黄孢子。缪西卡认出这些花正是生命之花，生命之花依靠史前能量母体哺育而成，它的主人因维人是人类和泰洛人的共同敌人，而现在花朵已经完成了进化，它们散发出的孢子正召唤着宇宙深处的因维人赶来地球。无数人追寻的史前能量母体终于被年轻的逃亡者发现，可这对于人类和泰洛人双方来说都为时已晚。 诺娃跟踪15小队一直抵达废墟，他们都没发现佐尔也尾随而至。生命之花盛开的壮观景象终于惊醒了佐尔·普莱姆沉睡着的前身记忆，他回想起他的本体——原始佐尔的所有计划和梦想，记起了前尘的因果恩怨，也洞悉了机器人统治者的阴谋。 近地太空中，爱默森将军亲上前线指挥。最后的决战开始了。
