Po czterdziestu latach zawieszenia broni Cyloni atakują 12 kolonii Kobolu. Ich strategia: wirus wszczepiony w system obronny ludzkości. Dawna Battlestar Galactica, która jest adaptowana do muzeum, nie jest związana z systemem obronnym i staje się jedynym okrętem wojennym zdolnym do walki z Cylonami w nadziei, że uda im się doprowadzić ocalałych do planety "Ziemia".
