Nu Kovac nog steeds op vrije voeten is, zoekt het team naar bewijs om hem op te sporen. Nadat Brennan een tegenslag ervaart, moet de rest van het team erachter komen hoe ze Kovac zonder haar kunnen vinden, waarbij ze alles wat ze hen ooit heeft geleerd op de proef stellen. Wanneer alle tekenen erop wijzen dat Kovac hulp van buitenaf heeft, en ook een schuilplaats, gaan Booth en Brennan op zoek naar hem.