L'assassinio di un marinaio dirotta le attenzioni sul serial killer dei porti, inducendo il direttore Vance a creare una task force composta dalle squadre di Gibbs e dell'agente speciale Barrett, con quest'ultima designata come capo investigatore. Nel frattempo, il team incontra Ray Cruz, il nuovo ragazzo di Ziva. Invece di dare il benvenuto a Ray, Tony lo tratta con freddezza. L'episodio si conclude con Ziva e DiNozzo in un bar, dove si trovano un bulbo oculare umano che galleggia nel gin tonic offerto da un avventore non identificato.
