Un messaggio (the bird song, il canto dell'uccello) di un ufficiale della marina deceduto, legato all'Intelligence della Difesa, guida il team di Gibbs alla ricerca di un manoscritto contenente informazioni su una operazione militare anti-terrorismo. Mentre la squadra indaga trovano il corpo di un agente dell'Fbi assassinato, e scoprono che entrambe le vittime erano coinvolte nella scrittura del libro. Quando dei funzionari dei servizi segreti della Marina cominciano a distruggerne tutte le copie esistenti, Gibbs è costretto a rintracciare l'anonimo autore, il quale permette la cattura del trafficante d'armi che aveva rubato un carico durante la missione, anche se alla fine non risulta essere lui, anzi lei, l'assassino.
