In un mondo devastato dalle inondazioni causate dall'ascensione della gigantesca nave aliena Orphan dalle profondità del mare, l'intera umanità è divisa in due fazioni: coloro che desiderano il successo di Orphan nel suo folle piano di distruzione di ogni forma di vita fuori dalla nave e coloro che desiderano impedire che ciò accada. I sostenitori di Orphan, i Reclaimer, usano mecha viventi chiamati Grand Cher. Gli oppositori di questi Reclaimer gestiscono la corazzata nota come Novis Noah e pilotano dei mezzi noti come Brain Powered. La storia si concentra, in particolar modo, sull'ex Reclaimer Yuu Isami e su una ragazza di nome Hime Utsumiya. I due combattono insieme per prevenire l'estinzione dell'umanità e per scoprire qual è il vero scopo di Orphan...