All'istituto di ricerca per l'energia fotoatomica si inizia a costruire il Jet Scrander con la lega Japanium, che permetterà a Mazinger Z di volare. Il dottor Hell però costruisce il mostro meccanico volante Genocider F9 e lo scaglia sul porto a distruggere le navi. Koji non riesce a resistere e parte con Mazinger Z per contrastarlo. Koji però cade in trappola, e mentre lui è al porto, Genocider vola verso l'istituto per distruggerlo. Una spia inviata dal barone Ashura disattiva la barriera per far distruggere il laboratorio e Sayaka e Shiro lo scoprono troppo tardi. I professori non fanno in tempo a collaudare il Jet Scrander e lo lanciano in cielo. Mazinger Z torna in tempo per agganciarsi alle sue nuove ali: ora riesce a volare. Koji non è ancora pratico dei nuovi comandi ma riesce a mantenersi a distanza dal mostro meccanico e a distruggerlo. Adesso che Mazinger Z può volare nel cielo, niente e nessuno potrà mai sconfiggerlo.
