Après que Moreau se soit réfugié à San Lorenzo, Nate implore l'équipe de l'aider à mettre la main sur lui. Pour se faire, ils doivent contacter l'opposant au régime, un homme qu'Eliot a sauvé. Mais parce qu'ils ont utilisé un logiciel appartenant à Moreau, ils arrêtent le Général Flores. Ils doivent alors trouver un autre opposant qui pourrait affronter le président en place.