La police trouve des corps coupés en deux et fait appel aux dons de John Doe pour démasquer le coupable. Doe pressent que les assassinats ont vraisemblablement leur source dans la séparation de jumeaux, enfants. En parallèle, il tente une nouvelle thérapie par l'hypnose pour découvrir sa véritable identité. L'expérience est vaine. Le psychiatre qui avait entrepris d'aider l'amnésique disparaît mystérieusement... Les policiers ne tardent pas à relier cet événement à la série de meurtres sur laquelle ils enquêtent...