Itachi est désormais le partenaire de Kisame, qui commence ses missions en tant que membre de l'Akatsuki. Le nouveau duo réussit à recruter Deidara. Pain charge alors l'équipe nouvellement formée de Deidara et Sasori de traquer le déserteur Orochimaru. Pendant ce temps-là, les informations concernant un tueur immortel poussent Itachi, Konan et Kakuzu à se diriger vers le pays de Yu.
