Le monstre liquide se retourne contre Robotnik et n'obéit plus à ses ordres. Le Chaos, comme l'a baptisé le savant fou, devient de plus en plus fort et redoutable pour la survie des humains. Devenu Perfect Chaos grâce au pouvoir des sept émeraudes, le hérisson se transforme en Super Sonic et bat ce dernier sans difficulté. Chaos redevient normal, mais perd sa férocité.