Leon Vance wurde nach dem Tod von Jenny Shepard zum neuen Director des NCIS ernannt und hat sogleich personelle Veränderungen vorgenommen. Seit drei Monaten ist das NCIS-Team nun schon in alle Winde zerstreut. McGee als Leiter der Abteilung für Internetkriminalität, Tony als Agent zur See, Ziva ist zurück beim Mossad in Israel. Als auf sie plötzlich ein Anschlag verübt wird, wird auch beim NCIS Alarm ausgelöst. Und langsam kommt Gibbs dahinter, was Leon Vance mit der Trennung beabsichtigt.
