Thornton, Leiter der Phoenix Foundation, wird Sicherheitschef für den bevorstehenden Staatsbesuch von Präsident Amundy. Zuvor aber soll er die Entschärfung einer Atombombe überwachen. Als dabei etwas schief geht, lässt Thornton sich pensionieren. Sein Nachfolger wird der fanatische Terroristenjäger Webber. MacGyver schöpft Verdacht: Sabotierte Webber Thornton, um an seinen Job heranzukommen?
