Drei Jahre sind seit der Gift-Attacke auf Präsident Palmer vergangen. Jack Bauer arbeitet wieder für die CTU, und auch seine Tochter Kim ist dort inzwischen als Computer-Spezialistin tätig. Chef der Abteilung ist Tony Almeida. Sie alle werden vor eine neue große Herausforderung gestellt, als Terroristen, die im Besitz eines tödlichen Virus sind, die Freilassung des Drogenbarons Ramon Salazar fordern. Sollte sich die Regierung weigern, drohen die Terroristen damit, das Virus in Los Angeles freizusetzen, von wo aus sich die Seuche in Windeseile über alle Erdteile ausbreiten würde...
