ชินจิโร่ (อุลตร้าแมน) ที่เห็นฝันร้ายเริ่มรู้ตัวว่าไม่อาจควบคุมพลังในตัวได้อีกต่อไป ไม่ว่าจะพยายามดิ้นรนเพื่อควบคุมมันแค่ไหน พลังของเขาปลดปล่อยออกมาเหนือการควบคุม เมืองย่อยยับ และผู้คนได้รับบาดเจ็บ สังคมเริ่มมองอุลตร้าแมนว่าเป็น "หายนะของมนุษยชาติ" ทำให้ฮีโร่ผู้นี้ตกเป็นเป้าการประณาม ชินจิโร่ผู้เดียวดายและสูญเสียทุกอย่างกลับพบว่าตัวเองอยู่ท่ามกลางชะตากรรมสุดปั่นป่วน ทว่าในเงามืดของความสับสนนั้น กองกำลังเอเลี่ยนที่น่าสะพรึงกลัวกำลังเคลื่อนไหวอย่างลับๆ
