ในซีซั่นที่ 1: เริ่มต้นจากที่ "Marvel's The Avengers" จบลง มันเป็นเพียงหลังจากการต่อสู้ในนิวยอร์ก และตอนนี้การมีอยู่ของฮีโร่และเอเลี่ยนได้กลายเป็นความรู้สาธารณะ โลกกำลังพยายามที่จะเข้ามามีส่วนร่วมกับความเป็นจริงใหม่นี้ เจ้าหน้าที่ฟิล โคลสันกลับมาปฏิบัติการอีกครั้ง และตอนนี้กำลังจับตาดูกลุ่มลึกลับชื่อ The Rising Tide เพื่อติดตามศัตรูที่มองไม่เห็นและไม่รู้จักนี้ เขาได้รวบรวมกลุ่มเอเจนต์กลุ่มเล็กๆ ที่ได้รับการคัดเลือกมาอย่างดีจากองค์กรบังคับใช้กฎหมายทั่วโลกที่รู้จักกันในชื่อ S.H.I.E.L.D.
