Serien handlar om styvbröderna Phineas och Ferb som gör allt de kan för att göra något av sommarlovet, istället för att bara slå dank hemma som alla andra. Medan Phineas och Ferb skapar de mest fantastiska projekt som verkar till synes omöjliga, så försöker alltid deras storasyster Candace att avslöja deras projekt för sina föräldrar, dock utan att lyckas. Under tiden pågår oftast en kamp med familjens näbbdjur Perry som är en hemlig agent med i uppdrag att stoppa Doktor Heinz Doofenshmirtz ondskefulla planer som han tänker släppa lös i Danville och trestatsområdet.