Peter Parker é aceito na Horizon High, uma escola para jovens mentes científicas brilhantes. Ele luta com a dualidade de sua vida social na escola e esconde sua identidade secreta de Homem-Aranha de todos, incluindo seu melhor amigo, Harry Osborn, que frequenta a concorrente Osborn Academy for Geniuses. Enquanto Peter abraça seu alter ego e luta contra supervilões como Vulture, Lizard, Doc Ock e Hammerhead, ele é forçado a assistir Harry descer lentamente para o lado errado do bem e do mal.