Zespół agentów specjalnych zajmuje się sprawami przestępstw, które mają związek z marynarką wojenną i piechotą morską. Kieruje nim Leroy Jethro Gibbs (Mark Harmon) - oficer śledczy i specjalista od przesłuchań. Agentka Kate Todd nadzoruje na pokładzie samolotu Air Force One pracę oficera marynarki Raya Trappa, który od niedawna ochrania głowę państwa. Podczas lotu oficer zostaje zaproszony przez prezydenta na lunch. Tuż po posiłku umiera. Samolot ląduje awaryjnie, a na jego pokład zostają wezwani agenci Gibbs i Tony. Abby wykonuje analizy, które mają ustalić przyczynę śmierci Trappa. Gibbs jest przekonany, że za śmiercią oficera marynarki kryje się plan ataku terrorystycznego.
