Na het beantwoorden van een noodsignaal van de U.S.S. Enterprise, seizoen twee toont de bemanning van de U.S.S. Discovery bundelt de krachten met kapitein Christopher Pike op een nieuwe missie om zeven mysterieuze rode signalen en de verschijning van een onbekend wezen genaamd de Rode Engel te onderzoeken. Terwijl de bemanning moet samenwerken om hun betekenis en oorsprong te ontrafelen, wordt Michael Burnham gedwongen haar verleden onder ogen te zien met de terugkeer van haar vervreemde broer Spock.
