In een toekomst wordt de aarde gedecimeerd na de ontdekking van een mysterieus, buitenaards ruimtevaartuig genaamd 'Orphan'. Een groep onderzoekers doorzoekt de planeet op zoek naar de schijfplaten van Orphan met behulp van een mecha genaamd 'Antibodies' om het vaartuig nieuw leven in te blazen, een gebeurtenis die zou resulteren in de totale vernietiging van alle levensvormen op aarde. De hoofdrolspelers Yu Isami en Hime Utsumiya moeten een speciaal antilichaam genaamd 'Brain Powerd' gebruiken om de Orphan plannen tegen te gaan en de mensheid te redden.
