Het verhaal van Alexey Savchuk, een verbannen slachtoffer van het Tsjernobyl-ongeluk in 1986, die de Exclusion Zone binnengaat om zijn verloren broer te vinden na 'De tweede catastrofe' , waar in 2006 een mysterieuze tweede explosie plaatsvindt in de kerncentrale. Geholpen door Seeker zal hij de wisselvalligheden van 'The Zone' ervaren en proberen zijn doel te bereiken. Stalker Team Uruguay heeft de videogame tot in de kleinste details tot leven gebracht, dus bereid je voor op het betreden van 'The Zone'!