닌자 조직으로부터 도망친 「탈주닌자」 히간은, 이름을 바꾸어 전 닌자 아내 마리와 사랑스런 렌과 조신하고 행복하게 살고 있었다. 그러나 어느 날 밤, 검은 옷을 입은 닌자들에게 습격당해 마리와 렌은 살해당하고 만다. 병원 영안실에서 숨이 돌아온 히간은 분노와 슬픔을 안고 조직에 대한 복수를 결심한다. FBI 수사관 마이크와 그 파트너 엠마와 함께, 이 사건의 배후에 있는 거대한 어둠에 맞서기 시작한다. 과거와 현재, 신뢰와 절망이 뒤엉키는 드라마틱한 이야기의 막이 열린다!