Continuando assieme il loro viaggio, i nostri eroi ed N si imbattono improvvisamente in un gruppo di scagnozzi del Team Plasma che stanno catturando ed usando degli innocenti Pokémon come cavie da laboratorio! Mentre imperversa una furiosa battaglia tra le due fazioni, N si ritrova nel mezzo del fuoco incrociato e viene ferito gravemente. Due donne misteriose fuoriescono da una fitta nebbia e portano lo svenuto N ad uno stagno nella foresta dove lo immergono mentre i nostri eroi assistono ammutoliti al dramma che si sta svolgendo sotto i loro occhi.
