Kirito, Asuna e Yui stanno riposando nella chiesa, trasformata in casa, dove Sasha si prende cura dei bambini più piccoli. Dopo pranzo arriva Yulier dell'Esercito. Yulier spiega che quando il capo dell'Esercito, Tinker, aveva buone intenzioni ad aiutare i giocatori, ma come l'Esercito, si è ampliata e persone come Kibaou hanno iniziato ad abusare di potere sugli altri. Thinker stava per espellere Kibaou per l'incidente al 74º piano, ma questi lo ha intrappolato in una prigione segreta al 1 ° piano ed è per questo che Yulier è venuta a chiedere a Kirito e Asuna aiuto. Con Yui, rifiutatasi di restare in chiesa, Kirito, Asuna e Yulier, a malincuore, la portano con loro per salvare Thinker. Quando arrivano alla sua posizione, un boss chiamato "The Fatal Scythe" li attacca. Kirito e Asuna ordinano a Yulier di fuggire insieme a Thiker e Yui mentre i due combattono il boss che si rivela però troppo forte. Il boss attacca Kirito e Asuna stordendoli. A quel punto arriva Yui che para il colpo del boss, mentre compare l'esagono con scritto “oggetto immortale” e dopo lo uccide con uno spadone infuocato. Yui, infine, ricordando il suo passato, rivela a Kirito ed Asuna che lei è un consulente AI (d’ intelligenza artificiale) creato dal sistema denominato “Cardinal” il cui scopo era quello di monitorare e consigliare i giocatori sul loro stato mentale. Il giorno del lancio del gioco, Cardinal le ha proibito di interagire con i giocatori ed è stata costretta a guardare il loro stato mentale deteriorarsi fino a quando è venuta a conoscenza di Asuna e Kirito e voleva incontrarli. Nonostante la rivelazione, Asuna e Kirito accettano ancora Yui come loro figlia, ma lei dice loro addio perché sta per essere cancellata a causa della sua interferenza nel gioco. Rifiutando di accettare, Kirito utilizza la console del GM (utilizzata prima da Yui per sconfiggere il boss) per salvare Yui trasformandola in un elemento di cristallo. Salvando Yui nei dati del suo NerveGear, Kirito e Asuna sperano di ricrearla nel mondo reale.