Dopo millenni di prigionia sotto forma di statua di pietra, lo Spirito del Caos Discord si risveglia nuovamente; questo essere bizzarro, per puro divertimento, vuole trasformare l'intera Equestria in una terra anarchica e grottesca; dopo aver celato l'unica arma in grado di fermarlo, gli Elementi dell'armonia, Discord mette alla prova le protagoniste facendogli credere che i preziosi artefatti siano collocati al centro del labirinto del palazzo di Canterlot, e tutto sembra essere perduto allorché lo Spirito del Caos, divide le sei amiche, poi usa i suoi poteri per ingrigire l'anima delle Mane 6 e minacciandone così la stessa amicizia e unione.