Kafka Hibino ha quasi abbandonato il suo sogno di unirsi alla "Forza di Difesa" anti-Kaiju. Ora lavora alla pulizia, eliminando i corpi dei Kaiju uccisi e ripensando con rammarico ai giorni trascorsi con la sua amica d'infanzia Mina Ashiro, capitano della Terza Divisione delle Forze di Difesa.
