Une météorite de l'espace s'écrase sur la Terre, et plus précisément sur le Japon. Sa taille est considérable et les garçons partent de la base pour vérifier sur place qu'il n'y a pas de catastrophe ou pire, une menace du royaume Yamatai. Hiroshi, arrivé sur le site, trouve une sphère lumineuse qui éclot bientôt comme un œuf d'où émerge le dernier monstre Aniba. Le jeune homme s'enfuit mais parvient bientôt à se transformer. Miwa atteint son compagnon et grâce aux composants, Jeeg revient à la vie et commence le combat. Mais le monstre a une surprise : grâce à une énergie spéciale, les roches adhèrent au corps de Jeeg, qui devient une météorite et part dans l'espace. Miwa le poursuit en essayant de le récupérer mais le monstre Aniba profite de l'absence des deux défenseurs pour attaquer la Base Antiatomique. Le vaisseau d'Himika, déjà dans l'espace, intercepte Jeeg piégé dans la météorite et est accueilli par les deux ministres maléfiques de l'Empereur.