Dartz à finalement réussi à réveillé le Grand Léviathan de son profond sommeil en échangeant l'âme de Joey et de Seto par la sienne. A présent, la grande créature s'apprête à anéantir le monde. Mais pour empêcher Dartz de mener a bien son projet, Yugi va devoir invoquer les trois plus puissants monstres de duel: Les Dieux Égyptiens.
