Ed se trouve à Lior où il apprend les intentions de Scar à propos de la pierre philosophale, et les moyens qu'il compte utiliser pour réussir à créer cette dernière. Au quartier général de l'armée, Mustang et ses hommes apprennent de la bouche de Al comment créer une pierre complète, et c'est pour cela que l'armée n'intervient pas, au grand regret d'Archer. Lors de l'évacuation de la ville, Ed se retrouve confronté aux Homonculus. En même temps, Scar affronte "the crimson alchemlist" , mais certains imprévus vont arriver ...