A peine un mois après l'élection de John à la présidence des Etats-Unis, alors que Jackie souhaitait un peu d'intimité, le couple a un deuxième enfant, John Junior, et John ne se prive pas de médiatiser cette naissance. Côté politique, le Président et Bobby tentent de convaincre leur père qu'il ne doit pas nommer Bobby procureur général, mais Joe insiste. Il veut en effet que Bobby puisse garder un oeil sur son frère et finit par obtenir gain de cause. Le directeur du FBI doit maintenant accepter d'avoir le jeune Bobby comme patron. De son côté, John s'apprête à gérer la crise de l'invasion de la baie des Cochons à Cuba...