Nelson et l'équipage du Neptune s'activent pour sauver un plongeur des profondeurs piégé à bord d'un sous-marin nucléaire qui s'est écrasé. Le plongeur est en fait Stan, le frère de Kowalski. Près du sous-marin, Crane risque sa vie pour sauver l'homme inconscient et le ramener sur le Neptune. Juste au moment où ils montent à bord du navire, deux missiles explosent près de celui-ci et l'endommagent. Il sombre sur le fond de l'océan. Nelson tente de rejoindre la surface à bord du sous-marin volant...