Alors qu'il est au volant de sa voiture en compagnie de Callen, Sam se fait arrêter par le FBI qui l'accuse de meurtre. Les faits qui lui sont reprochés concernent une femme qu'il affirme ne pas connaître. Pourtant, son ADN a été retrouvé sur le corps de la victime. Consternée, l'équipe décide - malgré les ordres de Granger - d'enquêter discrètement sur l'affaire pour disculper Sam. Leurs recherches les conduisent sur les traces de Turner, un ancien marine.