Shredder attire Splinter dans le Technodrome, cette fois avec la promesse qu'une arme en sa possession peut redonner forme humaine au sensei. Les Tortues affrontent un Krang géant, désormais doté d'un nouveau corps, en plein cœur de New York. Ils combattent ensuite les troupes de la Dimension X à l'intérieur du Technodrome, ce qui a pour effet de bannir la forteresse et ses occupants insidieux dans la Dimension X elle-même.