A peine installé à Dinotopia depuis leur naufrage, Frank Scott s'ennuie et contraint ses fils à quitter l'île malgré la mise en garde de la légende et les ravages de la terrible tempête. Pendant ce temps, les hors-la-loi de Quattrone mettent à jour une pierre d'émeraude enfouie dans un temple dédié aux tyrannosaures. Soudain, les autochtones subissent l'assaut de ces redoutables prédateurs, guidés par une force supérieure à celle des pierres solaires, censées d'ordinaire assurer leur protection...