Alors que Tails vérifie le système de sécurité du Typhon, l'alarme se déclenche : quelqu'un s'est introduit à bord de l'appareil. Il s'agit de Shadow qui, sans donner d'explication, décide d'éliminer Cosmo. Sonic et Knuckles tentent par tous les moyens de le retarder, mais en vain. Knuckles découvre que c'est Rouge qui est responsable de cette attaque en manipulant le hérisson noir. Tails fait à Cosmo la promesse de la protéger, au péril de sa vie s'il le faut. Alors que Shadow s'apprête à la tuer, Dark Oak parle à travers l'esprit de Cosmo et la félicite pour avoir accompli sa mission.
