Un tremblement de terre sous-marin enterre Moby et les garçons sous des tonnes de roche. Mais ils se retrouvent dans un monde sous-marin où Moby Dick doit protéger Scooby et les garçons de diverses créatures dangereuses comme les insectes géants, les palourdes, les algues mutantes, les anguilles et les Reptile Men alors qu'ils tentent de retrouver le chemin du retour.
