La historia gira en torno al protagonista masculino, Kirihara Aruto. Todo comienza cuando una noche Aruto está escribiendo su propia copia de la Alicia Eterna. De repente ve a una chica saltando a través del cielo nocturno. Entonces sale de su casa y la sigue a una biblioteca. Ve su lucha con otra chica, que luego fue derrotada. Entonces la antigua roba su historia y desaparece. Al día siguiente, ella se revela a sí misma como Arisugawa Arisu, el papel principal femenino de la historia. Explica que ella es una Alice usuario, capaz de transformarse en un kemonomimi bunnygirl que utiliza una clave en la lucha contra otros usuarios Alice. Las claves se utilizan para desbloquear las historias de otros corazones de usuarios Alice. Y el objetivo general de todos los usuario de Alice es derrotar a todos los demás y terminar el Alicia Eterna, y así ser a quien se le conceda un deseo. Más tarde aparece Kirihara Kiriha, la hermana pequeña de Aruto. Kiriha entonces se revela a sí misma como un usuario y procede a luchar. Aruto rompe la lucha y los dos hacen la paz con los demás. El trío luego se pone de acuerdo para ayudarse mutuamente a terminar el Alice Eterna. El resto de la serie sigue sus aventuras juntos.
