Después de enfrentarse con el dúo mutante de toro y topo Groundchuck y Dirtbag, las Tortugas y sus nuevos enemigos son llevados a Shellri-La por un "Turtleoid" alienígena llamado Kerma, donde nuestros héroes deben ayudar a defender su planeta de un dragón de dos cabezas llamado Herman El horrible.
