Nachdem der ehemalige Vize-Gefängnisdirektor E.B. Tiller ermordet in seinem Haus aufgefunden wurde, wird Detective Rebecca Madsen zu Rate gezogen. Am Tatort wird sie auf ein Foto aufmerksam, auf dem Tiller mit einem weiteren Mann zu sehen ist. Als das FBI plötzlich die Ermittlungen übernimmt, gelingt es Rebecca in letzter Sekunde, das Bild heimlich zu entwenden. Nicht nur die Tatsache, dass Rebeccas Großvater und ihr Ersatzonkel Ray Archer einst als Gefängniswächter auf Alcatraz gearbeitet haben, sondern auch ein Fingerabdruck auf dem Foto führen dazu, dass der Fall die Polizistin fesselt und sie beginnt, auf eigene Faust zu ermitteln. Der Fingerabdruck stammt nämlich von Jack Sylvane, einem ehemaligen Gefängnisinsassen, der jedoch angeblich bereits vor über 30 Jahren verstorben ist. Das seltsame Verhalten des FBI Agenten Emerson Hauser macht Rebecca stutzig und sie ahnt, dass ihr dieser etwas verschweigt und ihr bei der Lösung des Falls keine große Hilfe sein wird. Daraufhin beschließt sie, den Alcatraz-Experten und Comic-Liebhaber Dr. Diego „Doc“ Soto aufzusuchen. Die beiden machen eine unglaubliche Entdeckung: Eine Videokamera hat den angeblich toten Jack Sylvane aufgenommen, doch dieser ist kein bisschen gealtert, sondern sieht immer noch so aus, wie vor 50 Jahren. Rebecca und Dr. Soto versuchen, hinter das Rätsel zu kommen, allerdings bleibt ihnen hierbei nicht viel Zeit, denn Sylvane treibt bereits sein Unwesen in den Straßen San Franciscos und lässt sich von nichts und niemandem abhalten, seinen Racheplan zu vollziehen. Als der FBI-Agent Hauser erkennt, dass Rebecca nicht locker lässt, bietet er ihr schließlich die Zusammenarbeit an und die Ermittler stehen vor unzähligen Fragen: Ist Sylvane womöglich nicht der letzte Verschollene, der nun plötzlich wieder auftaucht? Und was ist in jener schicksalshaften Nacht im Jahr 1963 wirklich passiert?
