Бъдещето на планетата Земя е мрачно – смъртоносен вирус е опустошил повърхността и вещае края на човечеството. Затворникът Джеймс Коул е изпратен от 2043 в 2015 г., за да разобличи терористичната организация "12 маймуни", която се смята за отговорна за първоначалното пускане на вируса.
